严重急性呼吸综合征相关冠状病毒（SARS-CoV，SARSr-CoV）是引起严重急性呼吸综合征（SARS）的病毒。[2] 2003年4月16日，在亚洲爆发SARS并在世界其他地方发生继发性病例之后，世界卫生组织（WHO）发布了新闻稿，指出许多实验室鉴定出的冠状病毒是SARS的正式起因。该病毒的样品正在纽约，旧金山，马尼拉，香港和多伦多的实验室中保存。
CDC和加拿大国家微生物实验室于2003年4月鉴定出SARS基因组。[3] [4]荷兰鹿特丹伊拉斯姆斯大学的科学家证明，SARS冠状病毒符合科赫的假设，从而证实其为病原体。在实验中，感染了该病毒的猕猴表现出与人类SARS受害者相同的症状。[5]
SARS冠状病毒是世界卫生组织在埃博拉疫情后制定的一项新计划中将其确定为可能导致未来流行的几种病毒之一，该计划在流行于诊断测试，疫苗和药物之前和期间进行紧急研究和开发。[6] [ 7]
病毒分类
内容
1 SARS
2 历史
3 病毒学
4 形态
5 进化
6 参考
SARS
主条目：严重急性呼吸系统综合症
SARS或严重的急性呼吸系统综合症是由SARS冠状病毒引起的疾病。 它通常引起严重的疾病，最初以肌肉疼痛，头痛和发烧的全身症状为特征，然后在2-14天之内出现呼吸道症状[8]，主要是咳嗽，呼吸困难和肺炎。 SARS病人的另一个常见发现是血液中循环的淋巴细胞数量减少。[9]
在2003年的SARS爆发中，约9％确诊SARS感染的患者死亡。[10] 对于60岁以上的人群，死亡率要高得多，这一部分病人的死亡率接近50％。[10]
历史
主条目：严重急性呼吸系统综合症
2003年4月12日，在温哥华迈克尔史密斯基因组科学中心工作的科学家完成了对与SARS相关的冠状病毒基因序列的定位工作。该团队由马可·马拉博士（Marco Marra）领导，并与不列颠哥伦比亚省疾病控制中心和马尼托巴省温尼伯的国家微生物学实验室合作，使用了多伦多受感染患者的样本。该被世界卫生组织誉为在抗击非典方面迈出的重要一步，已通过GSC网站与世界各地的科学家共享（见下文）。多伦多西奈山医院的唐纳德·洛特博士将这项发现描述为“史无前例的速度”。[11]此后，其他独立小组已确认了SARS冠状病毒的序列。
后来在狗（Nyctereuteus sp。），雪貂badge（Melogale spp。）和家猫中也发现了该病毒。 2005年，两项研究在中国蝙蝠中发现了许多SARS样冠状病毒。[12] [13]这些病毒的系统发育分析表明，SARS冠状病毒很可能起源于蝙蝠，并直接传播或通过中国市场上的动物传播给人类。蝙蝠未显示任何明显的疾病迹象，但可能是SARS样冠状病毒的天然库。 2006年底，香港大学中国疾病预防控制中心和广州疾病预防控制中心的科学家建立了在小动物和人类中出现的SARS冠状病毒之间的遗传联系，证实了该疾病跨物种跳跃的说法 。[14]
病毒学
冠状病毒
SARS冠状病毒是属于包膜冠状病毒家族的阳性单链RNA病毒。它的基因组约为29.7kb，是RNA病毒中最大的基因组之一。 SARS病毒具有13个已知基因和14个已知蛋白质。 5'UTR中有265个核苷酸，3'UTR中有342个核苷酸。 SARS与其他冠状病毒相似，因为它的基因组表达始于两个大的ORFs 1a和1b的转移，这两个都是多蛋白。
这些蛋白质中的几种蛋白质的功能是已知的：[15] ORF 1a和1b编码复制酶，并且有四个主要的结构蛋白质：核衣壳，刺突，膜和包膜。它还编码八种独特的蛋白质，称为辅助蛋白质，所有这些蛋白质都没有已知的同源物。这些辅助蛋白的功能仍然未知。[16]
冠状病毒通常表达pp1a（ORF1a多蛋白）和PP1ab多蛋白，并带有ORF1a和ORF1b。然后，由ORF1a编码的酶处理多蛋白。加工产生的蛋白质包括各种复制酶，例如RNA依赖性聚合酶，RNA解旋酶和蛋白酶。冠状病毒中的复制复合物还负责ORF 1b下游各种mRNA的合成，这些mRNA是结构蛋白和辅助蛋白。两种不同的蛋白质3CLpro和PL2pro将大的多聚蛋白切割成16个较小的亚基。
SARS冠状病毒遵循冠状病毒属的典型复制策略。
该病毒的主要人类受体是血管紧张素转换酶2（ACE2），最早于2003年发现。[17]
形态学
SARS冠状病毒的形态是整个冠状病毒家族的特征。这些病毒具有大的多形球形颗粒，带有球形表面突起，在颗粒周围形成电晕。病毒的包膜含有脂质，似乎由一对不同的电子致密壳组成。
壳的内部组件是单链螺旋核糖核蛋白。 还存在从脂质包膜突出的长表面突起。 这些颗粒的大小在80–90 nm范围内。
演化
SARS-CoV与第2组冠状病毒最密切相关，但未分离到其他三组冠状病毒中。 有人提出了一种理论，即蝙蝠冠状病毒已经与其宿主共同进化了很长时间，然后将物种从蝙蝠跃迁到人类。[18] [19] 与冠状病毒最接近的外群是轮状病毒，与它在ORF 1b复制酶和S和M的两种viron蛋白具有同源性。根据一套保守的方法，SARS被确定是从第2组冠状病毒中分离出来的。 与组2共享的域。
第2组冠状病毒和SARS之间的主要区别是由ORF1a编码的nsp3复制酶亚基。 SARS没有木瓜蛋白酶样蛋白酶1。
另见
Carlo Urbani
Progress of the SARS outbreak
Severe acute respiratory syndrome
SL-CoV-WIV1
参考
"ICTV Taxonomy history: Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus" (html). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Retrieved 27 January 2019.
Thiel V (editor). (2007). Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology (1st ed.). Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-16-5.
"Remembering SARS: A Deadly Puzzle and the Efforts to Solve It". Centers for Disease Control and Prevention. 11 April 2013. Archived from the original on 1 August 2013. Retrieved 3 August 2013.
"Coronavirus never before seen in humans is the cause of SARS". United Nations World Health Organization. 16 April 2006. Archived from the original on 12 August 2004. Retrieved 5 July 2006.
Fouchier RA, Kuiken T, Schutten M, et al. (2003). "Aetiology: Koch's postulates fulfilled for SARS virus". Nature. 423 (6937): 240. Bibcode:2003Natur.423..240F. doi:10.1038/423240a. PMID 12748632.
Kieny, Marie-Paule. "After Ebola, a Blueprint Emerges to Jump-Start R&D". Scientific American Blog Network. Archived from the original on 20 December 2016. Retrieved 13 December 2016.
"LIST OF PATHOGENS". World Health Organization. Archived from the original on 20 December 2016. Retrieved 13 December 2016.
Chan-Yeung M; Xu RH (November 2003). "SARS: epidemiology". Respirology (Carlton, Vic.). 8 (Suppl): S9–14. doi:10.1046/j.1440-1843.2003.00518.x. PMID 15018127.
Yang M; Li CK; Li K; Hon KL; Ng MH; Chan PK; Fok TF (August 2004). "Hematological findings in SARS 病人 and possible mechanisms (review)". International Journal of Molecular Medicine. 14 (2): 311–5. doi:10.3892/ijmm.14.2.311. PMID 15254784. Archived from the original on 2015-09-24.
Sørensen MD; Sørensen B; Gonzalez-Dosal R; Melchjorsen CJ; Weibel J; Wang J; Jun CW; Huanming Y; Kristensen P (May 2006). "Severe acute respiratory syndrome (SARS): development of diagnostics and antivirals". Annals of the New York Academy of Sciences. 1067 (1): 500–5. Bibcode:2006NYASA1067..500S. doi:10.1196/annals.1354.072. PMID 16804033.
"B.C. lab cracks suspected SARS code". CBCNews, Canada. April 2003. Archived from the original on 2007-11-26.
Li W, Shi Z, Yu M, et al. (2005). "Bats are natural reservoirs of SARS-like coronaviruses". Science. 310 (5748): 676–9. Bibcode:2005Sci...310..676L. doi:10.1126/science.1118391. PMID 16195424.
Lau SK, Woo PC, Li KS, et al. (2005). "Severe acute respiratory syndrome coronavirus-like virus in Chinese horseshoe bats". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102 (39): 14040–5. Bibcode:2005PNAS..10214040L. doi:10.1073/pnas.0506735102. PMC 1236580. PMID 16169905.
"Scientists prove SARS-civet cat link". China Daily. 23 November 2006. Archived from the original on 14 June 2011.
McBride R; Fielding BC (November 2012). "The role of severe syndrome (SARS)-coronavirus accessory proteins in virus 发病机理". Viruses. 4 (11): 2902–23. doi:10.3390/v4112902. PMC 3509677. PMID 23202509.
McBride, Ruth; Fielding, Burtram C. (2012-11-07). "The Role of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)-Coronavirus Accessory Proteins in Virus 发病机理". Viruses. 4 (11): 2902–2923. doi:10.3390/v4112902. ISSN 1999-4915. PMC 3509677. PMID 23202509.
Li, Wenhui; Moore, Michael J.; Vasilieva, Natalya; Sui, Jianhua; Wong, Swee Kee; Berne, Michael A.; Somasundaran, Mohan; Sullivan, John L.; Luzuriaga, Katherine; Greenough, Thomas C.; Choe, Hyeryun (Nov 2003). "Angiotensin-converting enzyme 2 is a functional receptor for the SARS coronavirus". Nature. 426 (6965): 450–454. doi:10.1038/nature02145. ISSN 0028-0836. PMID 14647384.
Cui J; Han N; Streicker D; Li G; Tang X; Shi Z; Hu Z; Zhao G; Fontanet A; Guan Y; Wang L; Jones G; Field HE; Daszak P; Zhang S (Oct 2007). "Evolutionary relationships between bat coronaviruses and their hosts". Emerg. Infect. Dis. 13 (10): 1526–32. doi:10.3201/eid1310.070448. PMC 2851503. PMID 18258002.
Ge XY; Li JL; Yang XL; Chmura AA; Zhu G; Epstein JH; Mazet JK; Hu B; Zhang W; Peng C; Zhang YJ; Luo CM; Tan B; Wang N; Zhu Y; Crameri G; Zhang SY; Wang LF; Daszak P; Shi ZL (Nov 28, 2013). "Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor". Nature. 503 (7477): 535–8. Bibcode:2013Natur.503..535G. doi:10.1038/nature12711. PMC 5389864. PMID 24172901.
Peiris JS, Lai ST, Poon LL, et al. (April 2003). "Coronavirus as a possible cause of severe acute respiratory syndrome". Lancet. 361 (9366): 1319–25. doi:10.1016/s0140-6736(03)13077-2. PMID 12711465.
Rota PA, Oberste MS, Monroe SS, et al. (30 May 2003). "Characterization of a Novel Coronavirus Associated with Severe Acute Respiratory Syndrome". Science. 300 (5624): 1394–9. Bibcode:2003Sci...300.1394R. doi:10.1126/science.1085952. PMID 12730500.
Marco A. Marra; et al. (30 May 2003). "The Genome Sequence of the SARS-Associated coronavirus". Science. 300 (5624): 1399–1404. Bibcode:2003Sci...300.1399M. doi:10.1126/science.1085953. PMID 12730501.
Snijder EJ, et al. (29 August 2003). "Unique and conserved features of genome and proteome of SARS-coronavirus, an early split-off from the coronavirus group 2 lineage". J Mol Biol. 331 (5): 991–1004. CiteSeerX 10.1.1.319.7007. doi:10.1016/S0022-2836(03)00865-9. PMID 12927536.
Yount B, et al. (15 August 2006). "Rewiring the severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) transcription circuit: engineering a recombination-resistant genome". Proc Natl Acad Sci U S A. 103 (33): 12546–51. Bibcode:2006PNAS..10312546Y. doi:10.1073/pnas.0605438103. PMC 1531645. PMID 16891412.
Thiel V, ed. (2007). Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology (1st ed.). Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-16-5.
Enjuanes L, et al. (2008). "Coronavirus Replication and Interaction with Host". Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6. |
