人类冠状病毒HKU1（HCoV-HKU1）是带有HE基因的单链RNA病毒，可将其区分为βCoronavirus亚组A的成员。[1] 它于2005年1月的两名患者中发现。[2] [3]
HCoV-HKU1病毒体的插图
内容
1 HCoV-HKU1的发现
2 病毒学
3 流行病学
4 参考
发现HCoV-HKU1
HCoV-HKU1于2005年1月首次发现，当时是一名71岁的男子，他因急性呼吸窘迫入院并经影像学检查证实为双肺炎。[4] [2]
病毒学
Woo等人尝试从HCoV-HKU1生长细胞系的尝试失败，但是能够获得完整的基因组序列。系统发育分析表明，HKU1与小鼠肝炎病毒（MHV）的关系最为密切，在这方面与唯一已知的第2组人类冠状病毒HCoV-OC43有所不同。[2]
当分析RNA依赖的RNA聚合酶（RdRp），穗（S）和核衣壳（N）基因时，发现不相容的系统发生关系。对22株HCoV-HKU1菌株的完整基因组测序证实，这是由于自然重组所致。[5]
流行病学
对2003年SARS期间患有呼吸系统疾病的患者的SARS鼻咽负抽吸物进行追溯分析，确定了一名35岁肺炎妇女的样本中存在CoV-HKU1 RNA。[2]
在最初报告发现HCoV-HKU1之后，同年在澳大利亚北部的10名患者中发现了该病毒。在五月至八月之间（澳大利亚冬季）收集呼吸道样本。研究人员发现，大多数HCoV-HKU1阳性样本是在冬季后期的儿童中产生的。[6]
西半球的第一个已知病例是在康涅狄格州纽黑文的耶鲁-纽黑文医院的临床病毒学家分析了较旧的标本后发现的，他们好奇地发现HCoV-HKU1是否在其所在地区。他们在2001年12月至2002年12月的7周期间对851名婴儿和儿童进行了研究。从2001年12月至2002年2月的7周期间收集的标本中鉴定出该病毒。通过直接免疫荧光法检测人类呼吸道合胞病毒（RSV），副流感病毒（1-3型），甲型和乙型流感病毒和腺病毒，以及实时聚合酶链反应（RT-PCR）进行人间质肺病毒和HCoV-NH 。所有测试均为阴性。在851名儿童中，有2名HCoV-HKU1呈阳性。研究人员报告说，在纽黑文（New Haven）鉴定出的菌株与在香港发现的菌株相似。[7]在纽黑文发现的这种菌株有时也被称为HCoV-NH，对于发现它的纽黑文来说[8]。
2005年7月，法国报告了6例。在这些情况下，法国研究人员利用改进的技术从鼻咽抽吸物和粪便样本中回收病毒。[2]
参考文献：
Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung (2010-08-24). "Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis". Viruses. 2 (8): 1804–1820. doi:10.3390/v2081803. ISSN 1999-4915. PMC 3185738. PMID 21994708. In all members of βcoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).
Lau, S. K. P.; Woo, P. C. Y.; Yip, C. C. Y.; Tse, H.; Tsoi, H.-w.; Cheng, V. C. C.; Lee, P.; Tang, B. S. F.; Cheung, C. H. Y.; Lee, R. A.; So, L.-y.; Lau, Y.-l.; Chan, K.-h.; Yuen, K.-y. (2006). "Coronavirus HKU1 and Other Coronavirus Infections in Hong Kong". Journal of Clinical Microbiology. 44 (6): 2063–71. doi:10.1128/JCM.02614-05. PMC 1489438. PMID 16757599.
Vabret, A.; Dina, J.; Gouarin, S.; Petitjean, J.; Corbet, S.; Freymuth, F. (2006). "Detection of the New Human Coronavirus HKU1: A Report of 6 Cases". Clinical Infectious Diseases. 42 (5): 634–9. doi:10.1086/500136. PMID 16447108.
Woo, P. C. Y.; Lau, S. K. P.; Chu, C.-m.; Chan, K.-h.; Tsoi, H.-w.; Huang, Y.; Wong, B. H. L.; Poon, R. W. S.; Cai, J. J.; Luk, W.-k.; Poon, L. L. M.; Wong, S. S. Y.; Guan, Y.; Peiris, J. S. M.; Yuen, K.-y. (2004). "Characterization and Complete Genome Sequence of a Novel Coronavirus, Coronavirus HKU1, from 病人 with Pneumonia". Journal of Virology. 79 (2): 884–95. doi:10.1128/JVI.79.2.884-895.2005. PMC 538593. PMID 15613317.
Woo, P. C. Y.; Lau, S. K. P.; Yip, C. C. Y.; Huang, Y.; Tsoi, H.-W.; Chan, K.-H.; Yuen, K.-Y. (2006). "Comparative Analysis of 22 Coronavirus HKU1 Genomes Reveals a Novel Genotype and Evidence of Natural Recombination in Coronavirus HKU1" (PDF). Journal of Virology. 80 (14): 7136–45. doi:10.1128/JVI.00509-06. PMC 1489027. PMID 16809319.
Sloots, T; McErlean, P; Speicher, D; Arden, K; Nissen, M; MacKay, I (2006). "Evidence of human coronavirus HKU1 and human bocavirus in Australian children". Journal of Clinical Virology. 35 (1): 99–102. doi:10.1016/j.jcv.2005.09.008. PMID 16257260.
Esper, Frank; Weibel, Carla; Ferguson, David; Landry, Marie L.; Kahn, Jeffrey S. (2006). "Coronavirus HKU1 Infection in the United States". Emerging Infectious Diseases. 12 (5): 775–9. doi:10.3201/eid1205.051316. PMC 3374449. PMID 16704837.
Chang, Luan‐Yin; Chiang, Bor‐Luen; Kao, Chuan‐Liang; Wu, Mei‐Hwan; Chen, Pei‐Jer; Berkhout, Ben; Yang, Hui‐Ching; Huang, Li‐Min; Kawasaki Disease Research, Group (2006). "Lack of Association between Infection with a Novel Human Coronavirus (HCoV), HCoV‐NH, and Kawasaki Disease in Taiwan". The Journal of Infectious Diseases. 193 (2): 283–6. doi:10.1086/498875. PMID 16362893. |
